Hola, sabéis de algún programa de desfragmentación bootable, osea que arranque desde CD y no desde el S.O.
Por si te sirve, El hiren's boot cd lleva 3 o 4 desfragmentadores.
http://www.hiren.info/pages/bootcd
Por otro lado, hay desfragmentadores CommandLine, podrías crear un menu bootable con "EasyBoot" y arrancar dichos programas...
DESFRAGMENTADORES
Contig.exe - Defragmentador de archivos.
JKDefrag - En su día fue EL MEJOR Desfragmentador, quizás aún lo siga siendo para Windows XP...
NTRegOpt.exe - Registry Optimization for Windows NT/2000/2003/XP
DESCARGA (http://foro.elhacker.net/scripting/batch_packs_de_aplicaciones_varias_commandlineinterface_actualizado_05mayo-t322976.0.html)
Se poede hacer botable el Disk SpeedUp?