Me podrian explicar como se pasa un archivo por referencia a una funcion en lenguaje C.. cuando llamo a la funcion debo anteponer "&" antes del nombre del archivo o no? y como es la declaracion en la funcion?
Generalmente, tu variable que representa al archivo será un puntero a dicho archivo. Algo así:
FILE* pFileVar;
Justamente, al ser tu variable un puntero, no es necesario anteponer el ampersand ("&") cuando lo pasas como parámetro. Ya lo estás pasando por referencia tu archivo, al pasarle el puntero correspondiente (es decir, tu variable).
La declaración de la función sería algo así:
void foofile (FILE* pFile);
Y cuando quieras llamarla:
foofile(pFileVar);