Hola estaba revisando la situacion y encontre una solucion, copien las tablas que no les detecta al entrar al phpmyadmin, las pegan en otro lado y las borran de la ubicacion, posteriormente reinicien todos los servicios de la base de datos, creen las tablas con los nombres iguales y solamente metan una columna, algo sencillo, despues copien y peguen las tablas nuevamente en la carpeta que habian sacado y reemplacen los archivos y reinicien los servicios al volver a entrar encontraran todo como si nada hubiese sucedido !!!!