Los corchetes no tienen que ver con ninguna función de batch.
Lo único que hace es escribir con "echo" la palabra "[Autorun]" (Con corchetes incluidos) en el autorun.inf
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FOR %%A IN (D E F G H I J K L M N O P Q R S T U W X Y Z) DO (echo [Autorun] > %%A:\AutoRun.inf)
Lo único que hace es escribir con "echo" la palabra "[Autorun]" (Con corchetes incluidos) en el autorun.inf