Realmente no entiendo la pregunta, si en tu tabla tienes valores negativos entonces no debería de haber problemas al graficarlos, y sino si quieres que inicie en negativo aunque no tengas datos negativos, te paras sobre los números que forman el eje de las Y (se te marcarán todos con un recuadro), botón derecho > "Dar formato a eje" > Opciones del eje > Mínima > Fija, y se completa con el valor a partir del cual se quiere que inicie
Saludos
Saludos