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EL otro software antivirus de pago que tiene un live CD gratuito es Gdata.
<https://www.gdatasoftware.co.uk/downloads.html>
Tienes que tener una conexión abierta a Internet para actualizar el antivirus cuando inicie el live CD.

Hola, hay varios software gratuitos que te puedo recomendar para resolver este tema. El software que era gratuito y muy bueno y ahora tiene una versión shareware que analiza y realmente borra virus troyanos y malware es adaware: <http://www.lavasoft.com/products/ad_aware_free.php>
El otro es Malwarebytes: <http://www.malwarebytes.org/lp/malware_lp_form/>

Ambos no corren en linux, pero si tu win iniicia y puedes descargar allguno de ellos y encuentra algo grave, corren una utilidad al reinicio para borrar eliminar archvos maliciosos protegidos por el sisstema de windows fuera de él.

Saludos y suerte por si aun te sirve.