Yo todavía no programo a nivel profesional. Pero conozco como es el desarrollo que me mencionas. Por ejemplo si llegas a usar Qt puedes lograr una Magnifica integración con Eclipse: http://labs.qt.nokia.com/2007/07/11/develop-qt-applications-in-eclipse/
En NetBeans en las últimas versiones también está habilitado el desarrollo con Qt.
Claro Qt tiene su propia Suit "todo en uno": http://qt.nokia.com/products/developer-tools/
Desconozco si alguno de los dos tiene soporte para GTK, si tu propósito es usar las librerias de GTK entonces la solución es Anjuta: http://www.anjuta.org/
Si no dime en que librería piensas trabajar para confirmar el soporte.
Saludos
En NetBeans en las últimas versiones también está habilitado el desarrollo con Qt.
Claro Qt tiene su propia Suit "todo en uno": http://qt.nokia.com/products/developer-tools/
Desconozco si alguno de los dos tiene soporte para GTK, si tu propósito es usar las librerias de GTK entonces la solución es Anjuta: http://www.anjuta.org/
Si no dime en que librería piensas trabajar para confirmar el soporte.
Saludos