Claro el programa descomprime el contenido de la ISO en el disco, pero también se encarga de generar el Bootsector, que es algo así como imbisible, el Bootsector se encarga de que el disco inicie al encender el PC, ya después el control pasa al software que contenga el Disco y que haya sido lanzado por el Bootsector.
Saludos
Saludos