Wow.. bueno yo podria chequear las configuraciones de tus routers cisco a ver si tienen algun error pero eso estaria mal xq soy externo a su empresa y no debes dejar qcualqiera se meta con esos equipos tan delicados.. ps solo te recomiendo que si tienes algun tecnico que conozca cisco verifique la configuracion de los routers a ver si no encuentra nada raro tienen que estar muy alerta con las ACL verifiquen eso.. y en cuanto al servidor en eso no soy muy experto pero en el ISA server verifica las policies rules y access rules a ver si no ven algo que les impida el acceso normal..