Si no quieres liarte con un programazo tan enorme como los que te han mencionado (que sería algo asi como matar moscas a cañonazos) y si solo deseas unir dos videos te recomiendo el virtualdub si estan en avi o el tmpgenc si estan en mpg.
Saludos...
Songoku
P.D en mi web tienes ambos programas y tutoriales.
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Songoku
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