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Usa el gparted que tendrá la distro de linux que cargas como livecd para formatear las particiones del disco duro. Y luego instala el win7 con normalidad desde el dvd de instalación verás como ya no te da problemas.
Saludos...

Songoku

Para otra ocasión si los editores de recursos como el resource tuner, resource hacker, etc no te sirven lo que puedes hacer es usar el programa llamado File inspector para averiguar con que compresor esta comprimido el exe. Después ya solo sería buscar ese descompresor para descomprimir el exe, para por ultimo ya poder usar los editores de recursos antes mencionados sin problemas.

Lo malo es que los descompresores no es muy habitual que estén disponibles para la descarga pues suelen ser propietarios. Pero por suerte en muchos casos el compresor usado es el UPX que es un compresor libre que es bien fácil de encontrar en la red.
Saludos...

Songoku

Hay programas como el mediainfo que te permiten ver entre otras cosas el bitrate de compresion, el codec, etc tanto del video como del audio (los dos influyen el peso final). Con esos datos del bitrate luego puedes configurar el programa de recodificación (en este caso avidemux) para ponerle el mismo o un valor inferior si quieres que el archivo resultante pese igual o menos que el original.

Por supuesto si le pones mucho bitrate menos el peso será inferior pero perderás calidad. En cambio si le pones un bitrate mucho mayor el peso será mayor pero la calidad nunca podrá ser mejor que la del video original.
Saludos...

Songoku

Para averiguar el codec con el que esta comprimido un vídeo usa el programa llamado MediaInfo.
Así podrás comprimir todos los vídeos con el codec que soporte tu reproductor.

De todos modos esos desfases que dices que se te producen al convertir los vídeos son causados seguramente por falta de recursos del sistema durante la conversión. Para la conversión de vídeo hace falta un buen equipo y que ademas no haya corrupción en el sistema. Si hay corrupción ni el mejor equipo realizará una buena conversión.

Te aconsejo por tanto que formatees el disco duro e instales windows nuevamente. Y por supuesto no permitas que este se llene de porquería ni tengas tropecientas mil cosas cargadas al inicio (debe de ir bien fluido). Decir también que es VITAL que mientras estés haciendo las conversiones no hagas NADA MAS con el pc. El pc debe dedicarse en exclusiva a la conversión, por lo tanto no lo uses para NADA en esos momentos, vamos que ni siquiera toques el teclado y el ratón.
Saludos...

Songoku

O también puedes usar el easybcd para crear una entrada para linux en e gestor de arranque de windows. Así al encenderse el pc te aparecerá el gestor de arranque de windows en el que podrás elegir que sistema operativo de los dos bootear.
Saludos...

Songoku

Esta pagina http://www.whatsmyip.org/port-scanner te puede ayudar a comprobar tus puertos.
Saludos...

Songoku

El tema ha sido movido a GNU/Linux.

https://foro.elhacker.net/index.php?topic=436827.0

El tema ha sido movido a Hardware.

https://foro.elhacker.net/index.php?topic=436823.0

Tambien puedes usar un adaptador ide-sata. Por 3 euros que cuestan no creo que haga falta romperse mucho la cabeza si la placa base trae puerto ide o no.
Saludos...

Songoku

Las cosas buenas nunca cambian jeje 
Saludos...

Songoku