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Pues...

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public void setCapBanco(int[] banco)
{

for (byte i = 0; i < banco.length; i++)
banco[i]=(int) Math.floor(Math.random()*1000000);

}//fin del metodo setCapCaixaNv


Luego llamas a setCapBanco(vectorBanco1), setCapBanco(vectorBanco2), setCapBanco(vectorBanco3) y los va modificando
Como es memoria dinámica no hace falta devolverlo.

public void setCapBanco(int BANCO){

Le estas pasando un entero no un array!

Pues eso es exactamente lo que te he explicado antes. En java TODO ES DINAMICO y funciona con punteros.

Cuando te creas el json te creas una zona de memoria referenciada por un puntero (llamado json). Cuando tu haces eventos.put(json) no haces una copia de esa memoria y se guarda dentro de eventos, sino que eventos lo único que guarda es el puntero que apunta a esa zona de memoria que creastes en un principio. Por eso cuando haces el json.clearAll() afecta directamente al eventos.

Lo que en realidad estás haciendo es guardar dos punteros que apuntan a la misma zona de memoria.
Para arreglarlo en lugar de json.clearAll(); haz un json = new JSONObject();


Saludos y lo siento si no me he explicado bien

No se exactamente lo que preguntas pero lo que he visto es que el objeto json que insertas en evento es el mismo 2 veces.
Recuerda que java es todo dinámico. Lo que estás pasandole a eventos cuando haces eventos.put(json) es lo un puntero al objeto.

No se si esa era tu duda porque la verdad es que no se cual es el map en ese código... No se como funcionará internamente JSONArray.

[jmpi example]

Como ya te he dicho no lo conocía, por tanto no tengo ni idea de JMPI.
En google tienes un ejemplo.
Busca jmpi example y pincha en el primer pdf, tiene un ejemplo, es casi identico al mpi de c.

No conocía ninguna pero si conozco java y son mucho de poner J delante de todo.

JMPI es la respuesta que buscas

La solución que yo usé fue esta:

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public static void main(String[] args) {
String recurso = LecturaTxt.class.getSimpleName()+ ".class";
recurso = LecturaTxt.class.getResource(recurso).toString();
StringTokenizer token = new StringTokenizer(recurso,"!");
recurso = token.nextToken();
if(System.getProperty("os.name").toLowerCase().contains("windows"))
recurso = recurso.substring(10);
else
recurso = recurso.substring(9);
File x = new File(recurso);
x.getParent();
System.out.println(x.getParent());
}

En el IDE no te funcionará bien, pero cuando lo pases al jar verás como te devuelve la ruta absoluta del directorio donde se aloja el jar, independientemente del sistema operativo en el que estés

Creo que es culpa de la ruta relativa.
Prueba a usar la ruta absoluta. Si es por la ruta, postealo aquí y te digo como obtener la ruta absoluta independientemente del sistema operativo y la carpeta donde ejecutes el jar

Solo una cosa, el código del Space Invaders lo colgó [Case], dale las gracias a él
Suerte con el aprendizaje.

No desvirtuemos más el tema entonces

Ahora que recuerdo, hace un tiempo vi esto, lo mismo te ayuda.
http://www.felixgers.de/teaching/jogl/