Para eso si que tengo solucion. Batch usa un tipo de letra llamado terminal, que tiene cambiados los "caracteres especiales" (ñ, à, ü, í, ¿, etc). En el Mapa de Caracteres, cuando seleccionas como fuente "terminal" te salen todos los caracteres que puedes usar en un batch, simplemente selecciona el que necesites y copialo.