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Es cierto que GeSHi es poco descriptivo y, sobre todo para la gente nueva que entra, no se pondrá a jugar con cada una de las opciones de formato antes de postear su duda así que van a dejar el código en texto llano. Yo también lo he hecho.

Por eso en vez de tener el título GeSHi, la lista desplegable debería titularse 'elige tu lenguaje...' o 'Código en lenguaje...'; o algo que a primera vista ya diera a entender que eso sirve para que el código que va dentro se va a formatear en el lenguaje que se elija.

Sobre el libro que pides tienes un buen paper en esta dirección:
www.cimat.mx/~alram/cpa/pointersC.pdf

C no tiene capacidad para saber de que tipo es una variable, sólo le interesa lis bytes que ocupa. El elegir el tipo ya lo has hecho pasando a la función el dato con el bool y es el que debes usar para inicializar.
Para inivializar con bools el operador ternario va muy bien.

Código (c) [Seleccionar] Expandir

nave.capacidad = bando? 1500 : 2000;

Es del antivirus. Debes detenerlo, pausar-lo o poner en la lista de excepción a tu programa.

Ahora estaría bien que, para el resto de la gente con un problema similar al tuyo, expusieras el código al que has llegado.

Pues que tratas una tabla como un array unidimensional y que tratas un array unidimensional como un valor escalar.

Podrías probar de usar el algoritmo de Euclides que dice algo así:
1. Si el resto de la división entre el mayor y el menor es 0, el MCD es el menor.
2. Sino, realizar de nuevo la división entre el menor y el resto de la división anterior.
3. Repetir todo hasta que el punto 1 se cumpla.

En tu nueva versión hay un fallo de lógica que en la anterior estaba bien:

Código (c) [Seleccionar] Expandir

if(((Numero2 % PosDivj) == 0) && (PosDivi == PosDivj))

La versión que ahora tienes no cumple su trabajo:

Código (c) [Seleccionar] Expandir

if((Numero2%PosDivj)==0)

Los incrementos sin asignación:

Código (c) [Seleccionar] Expandir

PosDivj++;
PosDivi++;


El compilador te debe haber avisado de que

Código [Seleccionar] Expandir


c.c:16:24: warning: operation on 'PosDivj' may be undefined [-Wsequence-point]
                 PosDivj=PosDivj++;

c.c:19:16: warning: operation on 'PosDivi' may be undefined [-Wsequence-point]
         PosDivi=PosDivi++;


La función debe ser algo así

Código (c) [Seleccionar] Expandir

int MCD(Numero1, Numero2) {
    int PosDivi = 1;
    int PosDivj;
    int MaxCD = 0;
   
    while(PosDivi<=Numero1) {
        if((Numero1 % PosDivi) == 0) {
            PosDivj = 1;
            while(PosDivj <= Numero2) {
                if(((Numero2 % PosDivj) == 0) && (PosDivi == PosDivj)) {
                    MaxCD = PosDivi;
                }
                PosDivj++;
            }
        }
        PosDivi++;
    }
    return MaxCD;
}

C no controla los límites de los arrays y deja escribir en cualquier parte de la memoria, deja esa tarea al programador; parte de su velocidad viene de que no realiza estos chequeos.
Ahora bien, puede haber compiladores que hagan esta comprobación,  pero esto ya es funcionalidad añadida.
El sistema operativo también será tu perro guardián impidiendo que puedasbescribir en zonas de memoria diferentes a la memoria dedatos que ha asignado a tu programa.