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Antes de añadir los elementos guárdalos en variables o atributos de la clase, así los tienes accesibles para llamar a métodos de ellos.

Se bueno.

Hola:

Si quieres encargarte tú de las posiciones de los elementos (de todo), hazle al panel un setLayout(null) y a cada uno de los elementos llama a setBounds() para darle posición y tamaño.

Se bueno.

Hola:

No si te servirá, pero échale un ojo a la clase HttpsURLConnection http://java.sun.com/javase/6/docs/api/javax/net/ssl/HttpsURLConnection.html

Se bueno.

Según este post http://www.forosdelweb.com/f30/cual-smtp-pop-hotmail-483133/ el puerto ha cambiado de 25 a 587

Se bueno.

Hola:

Para que un JTextField vacío  tenga tamaño, pásale en el constructor el número de caracteres que quieres que visualice

textField = new JTextField(20);

Si quieres colocar los componentes en determinadas posiciones, el más completo es el GridBagLayout http://www.chuidiang.com/java/layout/GridBagLayout/GridBagLayout.php

Si quieres que se parezca a una especie de formulario (labels a la izquierda, textfields a la derecha y todo más o menos alineado), el layout adecuado es el GroupLayout http://java.sun.com/javase/6/docs/api/javax/swing/GroupLayout.html

Se bueno.

Hola:

Mira cual es el comando para lanzar tu navegador con la página html desde una ventana de ms-dos (línea de comandos). Luego, con java, puedes usar Runtime para lanzar ese comando. En el enlace puedes ver los detalles http://www.chuidiang.com/java/ejemplos/Runtime/runtime.php

Eso sí, sólo te servirá para un navegador concreto, el del comando que pongas.

Se bueno.

Hola:

Hay un hilo de java que se encarga de pintar las ventanas. Si dibujas el progress bar en ese hilo, haces las tareas que tengas que hacer en ese hilo e incrementas el progress bar en ese hilo, no lo estás dejando libre para que pinte el progress bar y se le vea avanzar. Las tareas y el incremento del progress bar debes hacerlo en un hilo separado, que no sea directamente en el actionPerformed() de un botón o el keyListener() de teclado (en general, en ningún evento de teclado o ratón).

Una opción que da java es usar un SwingWorker http://chuwiki.chuidiang.org/index.php?title=Ejemplo_sencillo_con_SwingWorker

Si quieres ampliar un poco más esta información y ver cómo hacer la barra de progreso sin SwingWorker, echa un ojo en http://chuwiki.chuidiang.org/index.php?title=El_hilo_de_awt

Se bueno.

Mira a ver si te sirve esto http://www.chuidiang.com/chuwiki/index.php?title=Ejemplo_sencillo_con_izpack

Se bueno.

¿Y cual es ese problema?

Se bueno.

Si no pones ruta, el directorio por defecto es el de ejecución de la aplicación. Si lanzas tu aplicación con eclipse, es el raíz de tu proyecto (porque eclipse te lo pone así). Si lanzas un servidor web con eclipse, es el directorio de eclipse. Si despliegas tu war en un Tomcat, el ejecutable es tomcat y el directorio es el del ejecutable de Tomcat.

En cualquier caso, esa ruta siempre puedes saber cual es ejecutando

String rutaDefecto = System.getProperty("user.dir");

Si tu aplicación es una aplicación web, con jsp o servlets y es ahí donde quieres escribir el fichero, lo suyo es que le preguntes al ServletContext cual es el path de la aplicación tuya (normalmente webapps/tu_aplicacion) y escribas en ese path.

Se bueno.