Pues no es muy normal que con una instalacion limpia haga eso, la verdad. Si tienes la particion hecha en tu HDD correctamente y estas instalando el sistema en C: no debería de haber ningún tipo de problema con el arranque del sistema. Contando también que, según tú, el orden de arranque es correcto. Has reseteado? Una vez que si te deja iniciar está todo en orden con respecto al sistema? esa máquina que has ensamblado es nueva? Disco duro en buen estado? Prueba bien lo ya comentado anteriormente.....
Saludos
Saludos