Ok, muchas gracias por los consejos!!!  
				
			
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if(strcmp(cadenauno,cadenados)==0){
      printf("Son iguales\n");
   }else{
      printf("Son distintos\n");
   } era por casualidad ya que quedaban cosas en el bufer? algo asi puede ser? porque si mando este codigo antes funciona (siempre que tenga comentado lo de cadenatres):  printf("cadenados:%s\n", cadenados);