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Gracias por sus respuestas. el archivo original lo puse en un struct, no se si tal vez estoy ingresando allí algo mal.
Mi código para el struct:

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struct IRIS{
double sl;
double sw;
double pl;
double pw;
string clase;

void llenarDatos(string linea){
stringstream ss;
ss << linea;
string token="";
for(int i=0;i<COLS;i++){
getline(ss,token,',');
stringstream aux;
aux << token;
switch(i){
case 0:
aux >> sl;
break;
case 1:
aux >> sw;
break;
case 2:
aux >> pl;
break;
case 3:
aux >> pw;
break;
case 4:
clase=token;
break;
}
}
}

string toString(){
stringstream ss;
ss << sl << "," << sw <<","<< pl << "," << pw << "," << clase;
return ss.str();
}
};


Mi codigo para leer el archivo:

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vector<IRIS> archivo::cargarDatos(string ruta){
IRIS muestra;
string linea="";
ifstream fichero;
vector<IRIS> datos;
fichero.open(ruta.c_str(),ios::in);
if(fichero.is_open()){
cout<<"ok"<<endl;
                while((getline(fichero,linea,'\n'))!=NULL){
  muestra.llenarDatos(linea);
datos.push_back(muestra);
        }
}else{
cout<<"error al abrir el fichero"<<endl;
}


return datos;
}

Hola,
bueno lo que estoy haciendo es leer un archivo y dividirlo en dos, pues hasta aquí todo bien, tengo los archivos creados con sus respectivos registros.
Pero al momento de leer uno de los archivos que cree antes y poner los datos en un vector, solo ingresa la primera linea del archivo al vector. Si mando a imprimir lo que devuelve de la función getline me muestra los demás registros.No se porque solo se ingresa la primera linea del archivo.

Este es el código que estoy utilizando, tal vez algún consejo?

Código [Seleccionar] Expandir

vector<string> archivo::cDatos(string ruta){
vector<string> datos;
fstream fichero;
fichero.open(ruta.c_str(),ifstream::in);
string linea="";
while(getline(fichero,linea,'\n')!=NULL){
cout<<"linea: "<<linea<<endl;
datos.push_back(linea);
}
fichero.close();
return datos;
}

Y en consola muestra(por ejemplo):

linea: 4.8,3,1.4,0.1,Iris-setosa
4.7,3.2,1.6,0.2,Iris-setosa
4.6,3.4,1.4,0.3,Iris-setosa