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mira, no estoy seguro, pero con la funcion filelen podras conseguir algo!!!
osea calcular el tamaño de los archivos a copiar y luego con un timer testear el tamaño de la copia!!

Es sencillo:
MsgBox ("Hola" & vbCrLf & "Mundo")
El vbCrLf es el que inserta el salto de linea .

Utiliza el Tane UP, CCleaner o cualquier otro programa para reparar el registro y me dices.

Probablemente sea un virus que esta repitiendo una determinada rutina cada 40 segundos como tu dices. te recomiendo que abras el administrador de tareas INICIO-EJECUTAR-TASKMGR.EXE o Alt+Ctrl+Supr , y en la pestaña de procesos selecciones 1 y lo termines aver si la falla se corrige, y asi con todos.

Prueba llevando la mother a un servicio especializado en el tema. Es probable que sea eso , si sigue asi es el micro.