Problemas con subtítulos

[G3N3S1S]

Estoy pasando una serie de AVI a DVD, convirtiendo primero con el TMPGenc, los subtítulos se ven perfectamente cuando lo reproduzco en AVI. Pero ya que he convertido a MPG con el TMPGenc en algunas conversaciones no salen los subtítulos, pero solo en pequeñas partes. Ya he checado en el AVI y si salen los subtítulos en esas partes. Uso el VobSub para ver los subtítulos, y el TMPGenc para convertirlos. ¿Qué creen que pudiera ser el problema?