Caracteres especiales en Java

[b7]

Hola amig@ del foro


estoy desarrollando un  scanner,  pero  tengo problemas con los caracteres especiales ejemplo é, ó etc. No los muestra

En primer lugar  leo desde un archiv.txt leo linea por linea, cuando leo la primera linea  la convierto en un array con este metodo

Código (java) [Seleccionar] Expandir

array1 = linea.toCharArray();  

y después hago comparaciones con un

Código (java) [Seleccionar] Expandir

for 

pero cuando comparo la letra ó con otra letra ó que la tengo en un array por aparte la comparación no me nuestra nada, cuando uso NetBeans no me muestra nada pero cuando uso eclipse si me muestra, pero el proyecto es en NetBeans
no se que me recomienda

gracias de ante mano