Pendrives cifrados

[Escribiente]

Hola!
Estoy pensando en usar algún pendrive cifrado para tener distros en live. Tengo dos dudas: primero, ¿qué es más recomendable en términos de seguridad, el cifrado por hardware o por software? (¿se pueden implementar los dos en un solo dispositivo?); también, si con un pendrive cifrado (bien por hardware o bien por software) puedo tener problemas para bootearlo al inicio según el ordenador en el que lo haga, vamos, que no lo pueda descifrar y no pueda ejecutar la distro que tengo en él.
¿Me podéis orientar con estas dudas?
Gracias!!!