Hay veces que los media queries (JS y CSS) funcionan y otras veces no

[Drakaris]

Hola, estoy haciendo mi web responsive con media queries CSS y JS, y lo tengo todo bien, me arrranca bien, pero... Hay veces que no me ejecuta los media queries es decir, yo estoy trabajando con un portátil de 12.3 pulgadas (2 en 1) que lo puedo transformar en tablet, en modo ordenadaor va bien, y cuando lo cambio a tablet mi PC, se ejecuta, pero aveces no se ejecuta, y nosé si eso es normal, aveces me ejecuta los media queries  (JS y CSS) y otras veces no, si no es normal, porque me está  pasando eso? Y que posible solución puede tener?

P.D: También lo tengo optimizado para móviles y en cambio, eso si me va bien.  
Gracias